精準醫療(Precision Medicine)是以個體化醫療為基礎、隨著基因組測序技術快速進步以及生物信息與大數據科學的交叉應用而發展起來的新型醫學概念與醫療模式。

精準醫療作為下一代診療技術，在精準性和便捷性上，較傳統診療方法有很大的技術優勢。一方面通過基因測序可以找出癌癥的突變基因，從而迅速確定對癥藥物，省去患者嘗試各種治療方法的時間，提升治療效果;另一方面，基因測序只需要患者的血液甚至唾液，無需傳統的病理切片，可以減少診斷過程中對患者身體的損傷。

精準醫療 機遇與挑戰并存

貴州貴安精準醫學研究院股份有限公司主要核心技術聚集于基于第三代基因測序技術為核心的優生優育醫學轉化、精準醫療、中藥現代化技術及臨床試驗、生物抗癌藥物研發及生物制品研發五大平臺。目前已建立集成化的中國最大的第三代基因測序中心，擁有目前最新的中藥新藥研發體系，與國內一流的腫瘤醫院和傳染病醫院建立了合作聯盟，在國際上具有獨特的優勢和基礎。

第三代基因測序技術具有讀長較長、樣本簡單、靈敏度高的特點，但測序準確率低，需要重復處理進行糾正。因此貴安精準醫療公司目前使用的處理平臺面臨以下難題：

①數據處理計算量大，對CPU性能要求較高。

②對網絡的需求比較大，節點間需要使用低延時、高帶寬的Infiniband高速網。

③序列比對計算間斷性的讀寫硬盤存儲性能越高，計算速度越快。數據訪問量巨大，對存儲性能、容量要求高。

④純三代拼接軟件要求高性能分布式計算集群有高IO、大內存、高帶寬、高穩定性等特點。

⑤生物基因類開源軟件眾多，部署復雜。

⑥部分應用的工作流程較為復雜，對自動化程度要求高。

“曙光經驗”搭建新一代生物信息處理平臺

為滿足貴安精準醫療公司現階段業務數據處理平臺的需求，如中醫藥現代化研發、生物制劑研發、基因測序、蛋白質分析等應用，曙光針對第三代基因測序平臺的特點，并結合自身在生命科學領域多年的技術積累，采用最新一代生物信息處理解決方案來構建業務處理平臺。

曙光提供的基于第三代測序平臺的技術服務及領先的整體解決方案，包括高密度的計算平臺、高性能的存儲系統、高速的數據網絡、簡單易用的生物信息應用軟件系統和作業調度系統以及系統全生命周期管理的在線運維平臺。

針對客戶機房較小的情況，曙光采用TC4600E刀片服務器進行搭建，其擁有更高計算密度、低系統功耗、低冷卻系統耗電量、布線簡單、更高可靠性、管理方便等特點。

針對第三代測序技術優化的存儲分級功能，曙光提供高速的IO讀寫性能，提升隨機讀寫IOPS，并使存儲聚合帶寬達到30GB/s以上。

平臺采用業界領先的EDR InfiniBand網絡(100Gb/s EDR)，其網絡帶寬是FDR的1.78倍，延遲只有0.61us，比FDR延遲低1/7，是當前最高帶寬、最低延遲的InfiniBand產品，更高帶寬、更低延遲的EDR能進一步提高網絡密集型應用程序的并行效率。

曙光提供生物信息應用軟件系統和作業調度系統，打造一體化的生物信息處理平臺，使客戶業務處理平臺的計算更加高效。

為進一步提高客戶業務處理平臺的運維水平，曙光提供針對生物信息領域量身打造的EasyOP在線運維平臺，可在數分鐘內完成對生物信息處理平臺所有節點的監控部署，客戶可通過Web瀏覽器和手機端隨時查看集群運行狀態，并通過在線運維平臺迅速定位故障并啟用自動化處理機制。

HPC+精準醫療，曙光助力生命科技發展

通過搭建曙光新一代生物信息處理平臺，貴安精準醫療公司將成為西南地區領先的基因測序、中藥現代化技術、生物抗癌藥物研發及生物制品研發領域的領先企業，能夠快速響應企業計算需求并得出結果。

采用“互聯網+”思維，將“曙光經驗”轉變為在線服務主動迎合客戶切實需求，曙光實現客戶資產全生命周期管理服務，并提供覆蓋資產全生命周期的全程專家支持的自動化運維。

曙光提供的生物信息處理解決方案能夠為貴安精準醫療公司提供高性能、易擴展的數據處理平臺，加速科研和應用成果的產生，促進整個生命科技相關各行業的蓬勃發展。