作為數字NHS關于網絡安全工作的重要組成部分，數字NHS與微觀簽訂的網絡安全協議，該協議從2018年6月起生效，將覆蓋英國所有NHS機構。

根據新簽訂協議，微軟公司將為數字NHS提供“一個甄別網絡異常情況的集中化管理的協同機制，它是通過微軟公司提供的險情甄別軟件實現的。”數字NHS發言人解釋到。

該軟件“通過智能分析，可以達到降低安全漏洞、減少惡意軟件攻擊的目的。”根據協議，微軟公司將對安裝XP、Server2003、SQL2005操作系統的現有設備提供系統升級。

7月12日發布的政府報，建議簽訂一項補充協議處理多余的操作系統，以達到有效保護信息的目的。政府報告稱“與微軟合作，可以減輕軟件遭受瞬時攻擊時所受的損害。”報告稱，XP系統將于2018年在全國范圍退出使用。據數字NHS的披露，目前只有4.7%機構仍然使用XP操作系統，這一數字從18個月前的18%的基礎上下降了不少。報告稱，“隨著2018年XP系統的全面停用，將逐步淘汰過時的平臺上運行的APP。”“地方機構應該在2018年之前，把過時的系統逐漸停用、取消或者升級。

今年五月，黑客專對微軟的一個系統漏洞設計的名為‘WannaCry’的網絡惡意攻擊，把數字NHS在網絡環境中的脆弱性暴露無遺，全球性的網絡攻擊中NHS遭受了重大打擊，20%機構都受此負面影響。

微軟從2014年4月開始不再為XP系統提供服務，但據數字衛生智能（Digital Health Intelligence 2015）– 2015年度NHS醫療設施數據顯示，20%的NHS機構依舊安裝和使用XP系統，90%的機構表示在某些部門，比如診所或影像設備上還使用該操作系統。